零几年有一个动画片，主角是小女孩，会召唤树妖，反派是女巫可以变成猫，我记得还有一个钟表铺。

根据您的描述,这部动画片很有可能是宫崎骏的电影《千与千寻》。

《千与千寻》是日本动画大师宫崎骏于2001年推出的一部奇幻动画片。主角是10岁小女孩千寻,她搬到乡下的新家后发现家中的小门通往一个神奇的世界。在那个世界里,她遇见了能召唤出树像妖怪的男孩千寻。千寻在妖怪世界里结识了新朋友,并最终打败了反派角色——会变成黑猫的女巫。

这个神奇世界里有一个巨大的摇摆钟表,里面住着一个能控制时间的神秘生物。千寻通过小门来回穿梭于现实世界和妖怪世界,展开一段奇妙的旅程。

这部影片通过千寻在两个世界的奇遇,讲述了一个少女勇敢追求梦想, final when由懵懂变得成熟的故事。它以高超的动画技巧,描绘出色彩斑斓的妖怪世界,给观众留下深刻的印象,被公认为是宫崎骏的巅峰之作之一。

所以,从您提供的信息判断,这部动画片应该就是著名的《千与千寻》,它具有小女孩主角、能召唤树妖的朋友、会变成猫的女巫反派,以及钟表铺等要素,跟您的描述吻合。