问：
怎么从lncrna编号知道具体rna名称
答：
从lncRNA的编号获取其具体名称有以下几种方法:
1. 检索lncRNA数据库。目前较为权威的lncRNA数据库有:
- LNCipedia:http://www.lncipedia.org/
- LncRNAWiki:http://lncrna.big.ac.cn/
- NONCODE:http://www.noncode.org/
在这些数据库网站上,可以直接输入lncRNA的编号,如NR_026817,它会返回对应的lncRNA名称,在这个例子中是H19。
2. 在NCBI上检索。在NCBI网站上,进入Nucleotide数据库,输入lncRNA的编号,如NR_026817,在返回的结果中会看到其对应的RNA名称,即H19。
3. 根据lncRNA编号推算。lncRNA的编号一般遵循以下规则:
- 以NR_开头,后跟6位数编号,如NR_123456
- 第一个数字表示RNA的类型,0表示mRNA,1表示tRNA,2表示rRNA,6表示lncRNA
- 中间4位数表示注册年份
- 最后2位数按注册先后顺序编号
所以,NR_026817这个编号可以推算出:
- 它是lncRNA,因为编号以6开头
- 它注册于2002年,因为中间4位数是0268
- 它是该年注册的第17个lncRNA
综上,要详尽地根据lncRNA的编号获取其名称,可以综合使用上述三种方法。首先根据编号推算出一定信息,然后在数据库和NCBI中检索,找到与推算信息吻合的lncRNA名称。如果三种方法都试过但还是找不到,很有可能该lncRNA编号对应的RNA名称信息尚未收录在现有数据库中。