搜索药物靶点时通过swisstargetprediction数据库搜索，

swisstargetprediction数据库是一种预测药物靶点的在线工具,可以帮助研究人员快速预测小分子化合物的潜在生物学靶点,以指导药物设计和发现。在该数据库中搜索药物靶点主要可以通过以下步骤:

1. 登录swisstargetprediction官网,在首页点击“Search your compound”输入框,输入您要搜索的小分子化合物的化学名、CAS号或SMILES字符串。系统会识别所输入的化合物信息,如果无法找到对应物质,请检查输入内容是否正确。

2. 在搜索结果页,可以看到该化合物的基本物理化学属性与结构信息。点击“Predict targets”按钮,系统会根据该化合物的化学结构,通过机器学习模型预测其潜在的生物学靶点,包括钙离子通道、GPCR受体、激酶等。

3. 预测结果会列出该化合物的前20-50个潜在靶点,包括靶点名称、类型、Uniprot ID、预测概率等信息。用户可以根据实验目的选择性关注某类靶点,也可以修改预测参数以调整预测数量。

4. 选择某个靶点Prediction,点击可以查看对应靶点的详细信息,包括蛋白质序列、结构域、生理功能、相关疾病等,有助于评估该靶点作为药物靶点的潜力。也可以下载对应的蛋白质结构文件用于后续研究。

5. 除了单一化合物预测外,swisstargetprediction也支持批量预测,可以预测化合物库中的多种化合物并比较其靶点 profiles,为药物Leads的优选提供参考。

综上,swisstargetprediction数据库可以为研究人员提供一个简便高效的工具,通过化合物结构来预测其潜在的生物学靶点,为药物设计和药理活性研究提供有益的参考信息。希望上述信息能对您有所帮助。